در پی مخالفت ها و جنجالی شدن امضای این تفاهمنامه ارگ ریاست جمهوری تصمیم گرفت تا نشست مشورتی را برگزار کند.
در این نشست علاوه بر رییس جمهور، رییس اجرایی حکومت، برخی از رهبران جهادی،عالم دین و رییس هر دو مجلس شورای ملی از شرکت کنندگان این نشست بودند که در نتیجه تصمیم گرفته شد تا در برخی موارد این تفاهمنامه اصلاحات آورده شود.
مبارزه با جدایی طلبان و آموزش کارمندان امنیت ملی افغانستان از سوی آی اس آی پاکستان، از جمله مواد این توافق نامه هستند که اشتراک کننده خواهان بازنگری آن شده بودند.